Program Studi Sarjana Mikrobiologi berdiri pada tanggal 7 Desember 2023 berdasarkan Surat Keputusan Menteri Pendidikan, Kebudayaan, Riset, dan Teknologi Nomor: 937/E/O/2023. Dengan mengusung keunikan tentang sustainability, program studi sarjana Mikrobiologi memiliki visi untuk menjadi rujukan dalam pengembangan dan inovasi teknologi mikroba menuju sistem nirlimbah terintegrasi (zero waste integrated system) bertaraf internasional dan menjunjung kearifan lokal. Selain itu, Program studi Sarjana Mikrobiologi juga fokus untuk mengembangkan dan mewujudukan green industry berbasis mikrobiologi. Program Studi Mikrobiologi fokus dalam memberikan pengembangan ilmu Mikrobiologi serta bioteknologi dalam menciptakan sistem nirlimbah terintegrasi (zero waste integrated system) bagi mahasiswa. Dengan keunikan dan keunggulan tersebut, lulusan program studi Mikrobiologi diharapkan tidak hanya menguasai dasar ilmu Mikrobiologi tetapi dapat mengembangkan dan mengaplikasikan ilmu Mikrobiologi di berbagai sektor kehidupan manusia. Selain itu, dengan berbekal keunikan tersebut, lulusan juga mampu menjadi bagian dari penggerak dan solusi terciptanya lingkungan dan bumi yang tetap ramah bagi semua makhluk di dalamnya. Program Studi Mikrobiologi berupaya menciptakan lulusan yang beretika, dan kompeten dalam menggunakan dan mengendalikan mikroorganisme sebagai konsep dasar menuju zero waste integrated system di lingkungan yang ikut membantu perkembangan ilmiah dan berkontribusi pada peningkatan kualitas hidup. Sistem pembelajaran akan menjadikan lulusan profesional dengan kualitas akademis tinggi, diakui atas kontribusinya terhadap peningkatan kondisi kehidupan melalui studi dan penerapan Mikrobiologi dalam bidang lingkungan, pertanian, pangan dan kesehatan. Pengembangan ilmu berbasis pada pengembangan institusi yang menjunjung potensi perdesaan dan kearifan lokal.