Misi Program Studi D-III Budi Daya Ikan Fakultas Biologi Universitas Jenderal Soedirman adalah: Menyelenggarakan pendidikan vokasi bidang budidaya ikan untuk menghasilkan lulusan yang beriman, jujur, peduli, bertanggung jawab, berjuang dengan ikhlas, dan pantang menyerah, berwawasan kebhinekaan dan kewirausahaan, dan mampu menyelesaikan pekerjaan budidaya ikan melalui pemilihan metode budidaya ikan yang sesuai dan penganalisisan data, serta mampu menunjukkan kinerja dengan mutu dan kuantitas yang nyata dan terukur. Menyelenggarakan penelitian terapan (applied research), penelitian aksi (action research), penelitian untuk pengembangan metode/teknik/cara baru, penelitian untuk pengujian benih/pakan/obat-obatan unggul yang relevan dengan pengembangan budidaya ikan di perdesaan. Menyelenggarakan pengabdian kepada masyarakat melalui aplikasi keterampilan/ kompetensi/metode (teknik/cara) baru/input produksi unggul di masyarakat untuk pemberdayaan ekonomi dan kesejahteraan masyarakat perdesaan. Membangun jejaring kerjasama dalam pengembangan dan penerapan ilmu pengetahuan dengan lembaga/perusahaan/unit usaha yang bergerak dalam budidaya ikan sebagai upaya peningkatan kompetensi lulusan.